O Conselho de Centro é composto pelo Diretor e Vice-Diretor do Centro, pelos 7 Coordenadores de Curso - Graduação, 9 Coordenadores de Curso - Pós-Graduação, 18 Chefes de Departamento, Diretor da Farmácia Escola, 6 representantes de Servidores Técnicos Administrativos e por um estudante representante de cada curso de graduação do Centro.